El Consejo está presidido por el Secretario de Bioeconomía de la Nación y está integrado por los titulares de los Ministerios o Secretarías de Estado competentes en materia agropecuaria, agroindustrial y pesquera de las provincias. Entre sus objetivos se destaca el proponer un diálogo entre autoridades nacionales y provinciales, identificar y priorizar problemáticas del sector productivo, prevé apoyo y cooperación técnica en actividades específicas y permite estar más cerca del pequeño productor.